Очень проблематично, если у вас там прописка. Японские консульства не работают в Крыму, и вам придется обращаться через другие регионы. Кроме того, могут возникнуть вопросы из-за санкций.
Я оформлял визу в Японию из Краснодара, хотя прописан в Севастополе. Главное — показать стабильный доход и бронь отелей. Консульство в Москве приняло документы без проблем, но ждать пришлось дольше обычного.
Vasa 
Ответы 5